Die Suche ergab 23 Treffer

von Anti
Fr Nov 16, 2018 9:58 pm
Forum: Allgemeines zu R
Thema: Entgeltliche Optimierung eines Agent-based models
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Re: Entgeltliche Optimierung eines Agent-based models

@Anti, hast du mal ein Profiling (z.b. rprof) von deinem Code gemacht um zu sehen wo die lahmen Stellen sind? Kannte die Funktion bislang nicht. Werde sie aber mal laufen lassen. Danke für den Tipp! Zum Schreiben der große Datenmengen auf die Festplatte: Das passiert ja erst am Ende eines Durchlauf...
von Anti
Fr Nov 16, 2018 11:43 am
Forum: Allgemeines zu R
Thema: Entgeltliche Optimierung eines Agent-based models
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Re: Entgeltliche Optimierung eines Agent-based models

Ich habe den Artikel überflogen und da steht auf Seite 19: SOFTWARE The source code for the agent-based model, with associated documentation, is freely available from the model library run by the OpenABM consortium: https://www.openabm.org/model/5014 Ja, zugegebenermaßen. Das hatte ich vergessen. A...
von Anti
Fr Nov 16, 2018 11:13 am
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Thema: Entgeltliche Optimierung eines Agent-based models
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Re: Entgeltliche Optimierung eines Agent-based models

Ist die Implementierung im Artikel angegeben? Schleppt auch die Implementierung der Autoren des Artikels gleich von Anfang an eine solche große Datenmenge mit sich rum? Nein, leider nur verbal geschrieben. Daß ich von Anfang an meine Daten so groß angelegt habe liegt daran, daß ich mehrfach gelesen...
von Anti
Fr Nov 16, 2018 10:51 am
Forum: Allgemeines zu R
Thema: Entgeltliche Optimierung eines Agent-based models
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Re: Entgeltliche Optimierung eines Agent-based models

Dann benötigst Du also eine Beschleunigung um den Faktor 200000. :shock: Wenn es um einen Faktor von 20 bis 50 ginge, wäre ich halbwegs optimistisch, dass sich das durch besseren Code realisieren lässt Nun, natürlich weiß ich, daß das Viel verlangt ist. Und andererseits wußte ich ja auch vorher sch...
von Anti
Fr Nov 16, 2018 10:39 am
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Thema: Entgeltliche Optimierung eines Agent-based models
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Re: Entgeltliche Optimierung eines Agent-based models

Danke! Das, wofür Du Dir die Laufzeit von 2 min wünschst, dauert bisher wie lange :?: ... vermutlich mehrere Wochen (habs bislang nie die 4500 Jahre simulieren lassen, da bereits 1 Jahr ca. 1.5 h braucht) :? Die 1,5 Stunden sind ein Durchlauf in der Schleife for (t in 0:4500) { #run simulations (ac...
von Anti
Fr Nov 16, 2018 10:31 am
Forum: Allgemeines zu R
Thema: Entgeltliche Optimierung eines Agent-based models
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Re: Entgeltliche Optimierung eines Agent-based models

Danke!
jogo hat geschrieben:
Fr Nov 16, 2018 10:23 am
Das, wofür Du Dir die Laufzeit von 2 min wünschst, dauert bisher wie lange :?:
... vermutlich mehrere Wochen (habs bislang nie die 4500 Jahre simulieren lassen, da bereits 1 Jahr ca. 1.5 h braucht) :?
von Anti
Fr Nov 16, 2018 10:28 am
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Thema: Entgeltliche Optimierung eines Agent-based models
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Re: Entgeltliche Optimierung eines Agent-based models

Kannst Du bitte nochmal verständlich zusammenfassen, was Du simulieren willst - bitte ohne auf die konkrete Umsetzung (Programmierung) einzugehen, aber detailliert in der Sache!? Stammt das Programm von Dir oder gibt es eine "Basis" (evtl. in einer anderen Sprache), auf der Du aufbaust? Hi Athomas,...
von Anti
Fr Nov 16, 2018 10:00 am
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Thema: Entgeltliche Optimierung eines Agent-based models
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Re: Entgeltliche Optimierung eines Agent-based models

hm, und wie groß ist eine solche Datei? Ich gehe mal von ca. 25 Mio Individuen aus, die in der gesamten Historie auftauchen. Die Datei wird dann imho schon ziemlich groß werden, also mehrere MB bis 1 GB (geschätzt). Gleich daneben steht in Deinem Code, dass auch die Datei runsummary.csv bei jedem S...
von Anti
Fr Nov 16, 2018 9:22 am
Forum: Allgemeines zu R
Thema: Entgeltliche Optimierung eines Agent-based models
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Re: Entgeltliche Optimierung eines Agent-based models

Stimmt es, dass pro Parameterkombination der gesamte Dataframe runlist (mit seinen 26 Mio Zeilen) jeweils in eine CSV-Datei geschrieben werden soll? Wie groß ist eine solche Datei? (ups, das war schon die zweite Frage) Ja, das stimmt, da ich für den besten Lauf die gesamte Historie haben wollte, um...
von Anti
Mi Nov 14, 2018 3:25 pm
Forum: Allgemeines zu R
Thema: Entgeltliche Optimierung eines Agent-based models
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Re: Entgeltliche Optimierung eines Agent-based models

ist das eigentlich die einzige Stelle, wo eine Funktion aus dem Paket rlist verwendet wird? Das Ablegen und das Zurückholen von R-Objekten - das können auch die Funktionen save() und load() von base R. Ja, das ist tatsächlich die einzige Nutzung des Pakets. Kann Dir aktuell tatsächlich auch nicht s...