Deutsches R-Forum

Hallo Leute, Ich verwende regelmäßig die Funktion split(), um einen data.frame zeilenweise in eine Liste zu packen um z.B. mittels lapply Plots mit Teildaten zu erstellen: data("iris") iris_list_hsplit <- split(iris,iris[,"Species"]) Bei meinem jetztigen Problem würde ich allerdi...

Sorry, so ganz schlau werde ich aus deiner Frage nicht. Geht es dir um das Erzeugen einer Grafik, in der die ECDF deiner Daten und die vorgegebene CDF dargestellt sind? Wenn du mit base graphics arbeiten willst, gibt es die ecdf() Funktion und auch ggplot2 hat mit stat_ecdf() eine vergleichbare Mögl...

Ich nutze fast nur noch ggplot2 Ich auch, aber auch da können einen unerwartete Probleme mit der Achsenformatierung heimsuchen... :roll: Erst neulich hatte ich den Fall, dass ggplot2 mir unbedingt die Werte einer kategorischen Variable alphabetisch sortiert aufzwingen wollte. Üblicherweise übernimm...

Was sind denn die 97212 Reihen? So wie dein Bild ausschaut, nimmst du diese als unabhängige Beobachten an - ist das auch so haltbar? Oder sind die irgendwie korreliert? Das sind Genexpressionswerte in der Einheit FPKM. Eine Zelle produziert Arbeitskopien von Genen, die gebraucht werden und deren Hä...

Hallo liebe R-Forum Leser, Ich brauche eure Hilfe bei der Wahl des richtigen statistischen Tests und dessen korrekter Interpretation. Ausgangspunkt sind numerische Genexpressionsdaten von denen ich vier biologische Replikate habe: str(genes.fpkm) 'data.frame': 97212 obs. of 5 variables: $ WT.CKH_0 :...

grid <- expand.grid(.fL=c(0), .usekernel=c(FALSE)) Die Funktion expand.grid stammt nicht aus dem caret-Paket, sondern erstellt data.frames mit den möglichen Kombinationen. Für den gezeigten Code entspricht das nur einer Zeile, nämlich 0 und FALSE - das Prinzip hinter expand.grid wird mit dieser Var...

Also gemacht habe ich sowas selbst noch nicht, da ich als Biologe zwar Netzwerke plotte, aber nicht mit Karten überlagere. Allerdings kann ich dir Katherine Ognyanovas Tutorial zur Visualisierung von Netzwerken wärmstens empfehlen, das so ziemlich jeden Aspekt abdeckt - auch das Überlagern mit Karten.