Deutsches R-Forum

Die Werte die bei naba_ecm stehen, also "A2M", "A2ML1", "ABI3BP" sind das Selektionkriterium. Sie müssen in Log2TPM in Name = c("LOC389834", "LOC100233156", etc) vorhanden sein. Alle Werte die dieses Kriterium nicht erfüllen möchte ich aus Log2TPM en...

Eigentlich nicht.
Ich möchte eine Tabelle filtern. So wie wenn man einen festen Wert in einer Spalte hat. z.B. filter(data, data$colname > 2), nur dass ich halt 1000 Bedingungen habe und diese in einer variablen gespeichert habe.

Filtern. z.B. habe ich es so versucht:
.

Da bekomme ich dann aber die Fehlermeldung: "Error: Result must have length 38552, not 1026"

Mit subset bekomme ich eine Auswahl mit 0 Observierungen.

Ich werde wahnsinnig. So schwer kann es doch nicht sein! Ich habe ein Objekt mit ca 1000 Werten. Tibble, Data Frame, vector alles schon mal auprobiert. dput(head(naba_ecm)) structure(list(NABA_MATRISOME = c("A2M", "A2ML1", "ABI3BP", "AC010330.1", "ACAN&qu...

Danke, ich probier das gleich mal aus.

Hallo, ich hoffe hiermit erfülle ich die Anforderungen an den Beispieldatensatz: rohdaten_keratine <- ### aus: dput(head(rohdaten_keratine)) structure(list(`8633 A` = c(234768, 3572.07, 190822, 128481, 73935.8, 233246), `8633 B` = c(226119, 3373.79, 201157, 121698, 65804.2, 213549), `8633 C` = c(220...

Danke schön, ich habe auch eine praktikable Lösung gefunden. Wie du bereits erwähnt hast kann man ja die Regexp Terme mit einem oder verknüpfen. Das funktioniert ganz gut für mich. collagen <- c("\\bCOL1A1\\b|\\bCOL1A2\\b|\\bCOL2A1\\b|\\bCOL3A1\\b|\\bCOL4A1\\b|\\bCOL4A2\\b|\\bCOL4A3\\b|\\bCOL4A...

Hallo, geplant ist tatsächlich eine komplexe Filterung mit vielleicht 60-100 Regex Ausdrücken. Hier mal die ersten 200 Werte aus der Spalte 3: dput(unique(Agilent_data[[3]])[1:200]) c(NA, "TIMP1", "SSR2", "TRIM28", "AEBP1", "PPP1CC", "CHI3L1&quo...

Jetzt habe ich gerade festgestellt, dass mit diesem Code Agilent_data[grepl("\\bMMP[1-9]\\b", Agilent_data[[3]]),] sich nur ein Term abfragen lässt. Ich hatte aber vor mir ein ganzes Set zusammenzustellen und dieses dann auf einmal abzufragen. der Versuch zwei Abfragen in einer Variablen z...

Super, vielen Dank.

Deine Variante mit grepl liefert genau das gewünschte Ergebnis. Aber warum? Ich hatte mich für Grep entschieden weil grepl nur True und False zurückliefert.

Gruß
Werner