Deutsches R-Forum

Ist die Implementierung im Artikel angegeben? Schleppt auch die Implementierung der Autoren des Artikels gleich von Anfang an eine solche große Datenmenge mit sich rum? Nein, leider nur verbal geschrieben. Daß ich von Anfang an meine Daten so groß angelegt habe liegt daran, daß ich mehrfach gelesen...

Ich habe den Artikel überflogen und da steht auf Seite 19: SOFTWARE The source code for the agent-based model, with associated documentation, is freely available from the model library run by the OpenABM consortium: https://www.openabm.org/model/5014 Ist die Implementierung im Artikel angegeben? Sch...

Was ich jedoch anderenorts über Optimierungen gelesen habe, hat mich hoffen lassen (beispielsweise eine Beschleunigung um den Faktor 10000 durch Rcpp, etc.). Und dann das Gerede, daß R mit anderen Sprachen gleich performt ... Rcpp macht etwas ganz anderes. Meine Schätzung bezieht sich nur auf die M...

Dann benötigst Du also eine Beschleunigung um den Faktor 200000. :shock: Wenn es um einen Faktor von 20 bis 50 ginge, wäre ich halbwegs optimistisch, dass sich das durch besseren Code realisieren lässt. Die 1,5 Stunden sind ein Durchlauf in der Schleife for (t in 0:4500) { #run simulations (actions ...

Danke! Das, wofür Du Dir die Laufzeit von 2 min wünschst, dauert bisher wie lange :?: ... vermutlich mehrere Wochen (habs bislang nie die 4500 Jahre simulieren lassen, da bereits 1 Jahr ca. 1.5 h braucht) :? Die 1,5 Stunden sind ein Durchlauf in der Schleife for (t in 0:4500) { #run simulations (ac...

hm, und wie groß ist eine solche Datei? Ich gehe mal von ca. 25 Mio Individuen aus, die in der gesamten Historie auftauchen. Die Datei wird dann imho schon ziemlich groß werden, also mehrere MB bis 1 GB (geschätzt). Und wie ich das momentan sehe, möchtest Du mindestens 96000 solcher Dateien anlegen...

Hallo Anti, Stimmt es, dass pro Parameterkombination der gesamte Dataframe runlist (mit seinen 26 Mio Zeilen) jeweils in eine CSV-Datei geschrieben werden soll? Wie groß ist eine solche Datei? (ups, das war schon die zweite Frage) Ja, das stimmt, da ich für den besten Lauf die gesamte Historie haben...

Hallo Anti, ich habe eine kleine Frage: Stimmt es, dass pro Parameterkombination der gesamte Dataframe runlist (mit seinen 26 Mio Zeilen) jeweils in eine CSV-Datei geschrieben werden soll? Wie groß ist eine solche Datei? (ups, das war schon die zweite Frage) Hier noch eine heiße Spur zu dem Fehler b...

Das Skript ist für ein Tool geschrieben worden. Ist denn der Autor noch greifbar? In diesem Tool soll eine Datei eingegeben werden und die Daten in der hiesigen Datei sollen auf Dubletten überprüft werden. Könnt ihr mir sagen, an welche Stelle des Skripts erkennbar ist, dass er diese Prüfung durchf...

Da hast du wohl recht, ich habe hier mal das ganze mit Beispieldaten: ... #Edit: Die Beispieldaten geben nicht immer einen echten Baum aus, einfach ein paar mal probieren bis echte Blätter am Baum entstehen. Du könntest am Anfang set.seed(...) aufrufen (und nachdem Du einige Varianten probiert hast...