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von Curnen
Mi Jan 10, 2018 11:59 pm
Forum: Allgemeines zu R
Thema: Allgemeine Frage
Antworten: 5
Zugriffe: 1025

Re: Allgemeine Frage

Also leider habe ich noch große Probleme damit, überhaupt die Ausgangssituation zu verstehen. Deshalb mal anhand des gleitenden 100er Durchschnitts: Du hast also 100 aufeinanderfolgende Punkte über die du den Durchschnitt gebildet hast. Mit 30% Wahrscheinlichkeit liegt jetzt nur der 101. Punkt darüb...
von Curnen
Mi Jan 10, 2018 11:40 pm
Forum: Grafik
Thema: ggplot2: Von stat_density2d() berechneten level auslesen
Antworten: 2
Zugriffe: 775

Re: ggplot2: Von stat_density2d() berechneten level auslesen

Hallo EDi, Mal wieder: DANKE DANKE DANKE! Du hast nicht nur mein aktuelles Problem gelöst (die getLevel Funktion ist mehr als ausreichend für meine Bedürfnisse) sondern mit dem Hinweis mich auch noch mit der Nase auf die mir bislang nicht bekannten Pakete ggrepel und ggpmisc gestoßen. Beide sehen se...
von Curnen
Mi Jan 10, 2018 12:20 pm
Forum: Grafik
Thema: ggplot2: Von stat_density2d() berechneten level auslesen
Antworten: 2
Zugriffe: 775

ggplot2: Von stat_density2d() berechneten level auslesen

Hallo liebe Leute, Ich brauche mal wieder eure Hilfe mit einem zweidimensionalen Datensatz, den ich gerne mit ggplot2 als Streudiagramm darstellen würde. Ein Großteil der Datenpunkte konzentriert sich auf wenige Bereiche, sodass da viele Punkte ununterscheidbar aufeinander liegen. Deswegen nutze ich...
von Curnen
Di Jan 02, 2018 4:55 pm
Forum: Grafik
Thema: Schritte auf X-Achse
Antworten: 1
Zugriffe: 1812

Re: Schritte auf X-Achse

Für eine Antwort würde es helfen, zu wissen wie du deinen Plot erzeugst ;) - beispielsweise mit ggplot2, lattice oder base graphics. Wenn es base graphics ist, dann mit

Code: Alles auswählen

 axis(at=...)
Ein komplettes Beispiel gibt es hier
VG
Matthias
von Curnen
Di Dez 12, 2017 8:35 pm
Forum: Regressionsmodelle
Thema: Beta-Funktion auf Methylomdaten fitten
Antworten: 8
Zugriffe: 1662

Re: Beta-Funktion auf Methylomdaten fitten

Nachdem ich es ein paar Tage liegen lassen musste, kann ich jetzt vermelden: Es läuft! Vielen vielen Dank nochmal für eure Hilfe! functions_to_fit.R # Modified Beta function with shape1=shape2 fixed as used with Methylseeker dbetamod <- function (x, shape1, ncp = 0, log = FALSE) { dbeta(x,shape1 = s...
von Curnen
Mi Nov 15, 2017 6:46 pm
Forum: Regressionsmodelle
Thema: Beta-Funktion auf Methylomdaten fitten
Antworten: 8
Zugriffe: 1662

Re: Beta-Funktion auf Methylomdaten fitten

Alternativen wären zero/one inflated beta, eine globale transformation https://stats.stackexchange.com/a/134297/1050 oder was ganz anderes. Die im dem StackExchange-Beitrag genannte Formel für die Transformation sieht gut aus. Finde ich unschön. Fakt ist dass die beta-Verteilung nicht zu den Daten ...
von Curnen
Di Nov 14, 2017 9:01 pm
Forum: Regressionsmodelle
Thema: Beta-Funktion auf Methylomdaten fitten
Antworten: 8
Zugriffe: 1662

Re: Beta-Funktion auf Methylomdaten fitten

Hallo ihr Beiden, Danke für eure Zeit und die Antworten. Die beta-Verteilung schließt die 0 und 1 nicht mit ein - könnte das Problem erklären (mir scheint du hast viele solcher Werte). Jep, das war tatsächlich ein Problem, das ich mir ungefähr zeitgleich mit deiner Antwort dann endlich auch zusammen...
von Curnen
Di Nov 14, 2017 5:35 pm
Forum: Regressionsmodelle
Thema: Beta-Funktion auf Methylomdaten fitten
Antworten: 8
Zugriffe: 1662

Beta-Funktion auf Methylomdaten fitten

Hallo liebe Forum-Helfer, Ich bräuchte Hilfe dabei, die Beta-Funktion auf meine Daten zu fitten. Es handelt sich dabei um Messdaten aus epigenetischen Analysen, die den Wertebereich zwischen 0 und 1 annehmen können. Ihre Häufigkeitsverteilung wird in etlichen Fachpublikationen mit der Beta-Funktion ...
von Curnen
Di Nov 14, 2017 12:44 pm
Forum: Grafik
Thema: ggplot2: Fehler bei geom_text, woran liegts?
Antworten: 3
Zugriffe: 1287

Re: ggplot2: Fehler bei geom_text, woran liegts?

Also ich bin generell ein Fan davon, alle benötigten Werte zuerst zu berechnen und dann "nur" zu plotten. Hilft dir denn das hier weiter? MiWaRe <- structure(list(MiWaReVe = structure(c(7L, 7L, 14L, 17L, 17L, 17L), .Label = c("", "0", "1.1.", "2.1.",...
von Curnen
Fr Aug 11, 2017 11:14 am
Forum: Allgemeines zu R
Thema: split() vertikal auf data.frames anwenden?
Antworten: 3
Zugriffe: 898

Re: split() vertikal auf data.frames anwenden?

Hallo jogo, Vielen Dank, das ist für meine Bedürfnisse perfekt - ich wollte nur umgehen, die Gruppen und ihre Anzahl manuell in den Code schreiben zu müssen, mit deiner Lösung kann ich sie der Funktion jetzt als Variablen übergeben. Das P.S. wäre nur Spielerei - ich hab eben kurz was auf Basis von m...