Korrelation

[RProjekt]

Hallo,
ich würde gerne mit R eine Korrelation zwischen zwei Netzwerken berechnen. Nun habe ich in R die Funktion gcor(Netzwerk1, Netzwerk2) eingegeben. Jedoch zeigt mir R nur Error an. Ich vermute es liegt daran, dass die Netzwerke verschiedene Größen haben. Weiß einer wie man die Größen von Netzwerken in R ändern kann?

[jogo]

Hallo RProjekt,

willkommen im Forum!
Bitte gib uns ein reproduzierbares Beispiel.

Bei mir sieht das so aus:

Code: Alles auswählen

> gcor()
Fehler in gcor() : konnte Funktion "gcor" nicht finden

Weißt Du warum? ...
Außerdem habe ich auch keine Daten Netzwerk1 und Netzwerk2.

Gruß, Jörg

ich würde gerne mit R eine Korrelation zwischen zwei Netzwerken berechnen. Nun habe ich in R die Funktion gcor(Netzwerk1, Netzwerk2) eingegeben. Jedoch zeigt mir R nur Error an. Ich vermute es liegt daran, dass die Netzwerke verschiedene Größen haben. Weiß einer wie man die Größen von Netzwerken in R ändern kann?

[bigben]

Hallo Jörg,

er hat doch geschrieben, dass Du die Funktion erst eingeben musst. Ein Beispiel für sowas könnte folgende Funktion sein:

Code: Alles auswählen

gcor <- function(Netzwerk1=FALSE, Netzwerk2=FALSE) while(TRUE) cat("Error ")

Da ist es auch gar kein Problem, wenn Du keine Daten hast. Netzwerk1 und Netzwerk2 sind ja vorbelegt.



Hallo RProject,

ich wette mit Dir, dass R nicht "nur Error anzeigt". Ganz bestimmt ist die Fehlermeldung deutlich umfangreicher. Ohne zu sagen mit welchen Daten, ohne zu sagen in welchem Umfang und mit welchem Aufruf genau die Fehlermeldung kommt und wie genau die Fehlermeldung lautet grenzt den Fehler ein auf jeden nur denkbaren Fehler den man mit einer Funktion diesen Namens produzieren kann. Für eine Antwort, die in einen Forumspost passt, musst Du deutlich genauer eingrenzen.

LG,
Bernhard

[jogo]

Hallo Bernhard,

Hallo Jörg,

er hat doch geschrieben, dass Du die Funktion erst eingeben musst.

ich habe das als Eingeben auf der Kommandozeile interpretiert (oder in einem Skript).
Ich glaube, dass meine Interpretation richtig sein könnte, siehe https://stackoverflow.com/questions/504 ... twork-in-r
Dort gibt es bereits eine Funktion gcor() und unser neues Forumsmitglied wollte uns nur nicht die verwendeten Pakete verraten (oder so ähnlich).

Gruß, Jörg

[bigben]

Hallo Jörg,

ich habe Dich schon verstanden. Die dort genannte Funktion gibt aber wahrscheinlich nicht nur Error aus. Meine schon. Du kannst meine gcor-Funktion aber auch gerne direkt in die Kommandozeile eingeben

LG,
Bernhard

[RProjekt]

Code: Alles auswählen

gcor(Netzwerk1, Netzwerk2)
Error in if (dim(temp2)[2] > dim(temp1)[2]) temp1 <- add.isolates(temp1,  : 
  argument is of length zero

so sieht die Fehlermeldung bei mir aus. Mit der if Funktion klappt es bei mir auch nicht. Zuvor habe ich zwei Matrizen in R eingelesen und mit der Funktion as.network die zugehörigen Netzwerke erstellt. Das hat noch alles geklappt. Danach wollte ich mit der Funktion gcor die beiden Netzwerke vergleichen. Er spuckt mir jedoch nur oben genannte Fehlermeldung aus.

Für jeden weiteren Lösungsvorschlag wäre ich sehr dankbar

[jogo]

Kannst Du bitte mal den Output von

Code: Alles auswählen

class(Netzwerk1)
class(Netzwerk2)

in Deine nächste Nachricht kopieren?

Gruß, Jörg

[RProjekt]

gebe ich oben im Skript class(Netzwerk1) bzw. class(Netzwerk2) an, zeigt er mir unten das an:


> class(Netzwerk1)
[1] "network"
> class(Netzwerk2)
[1] "network"
>

[jogo]

und was macht

Code: Alles auswählen

gcor(list(Netzwerk1, Netzwerk2))

Bitte lies viewtopic.php?f=20&t=29
und verwende zukünftig Formatierungen!

Gruß, Jörg

[RProjekt]

Code: Alles auswählen

>gcor(list(Netzwerk1,Netzwerk2))
Error in gcor(list(Netzwerk1, Netzwerk2)) : 
  Identical graph orders required in gcor.

Dann wirft er mir das raus.
Danke mit dem Hinweis mit den Formatierungen

Liebe Grüße