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Fisher's exact test

Verfasst: Mi Jul 04, 2018 7:54 pm
von Julia_S
Guten Abend,

ich habe verschiedene Rasterdaten (Ausgangsgestein, Kationenaustauschkapazität, Bodentyp etc.) und ich muss durch einen Test beweisen, dass diese abhängig/unabhängig voneinander sind.
In meiner dafür erstellen Kreuztabelle sind auch einige Zellen mit dem Wert 0, deswegen habe ich mich gegen den Chi Square Test und für den Fisher's Exact Test entschieden.

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library(stats)
#set memory limit
memory.limit()
## To increase the storage capacity
memory.limit(size=56000)
tab2<- read.csv("Ausgangsgestein_KAK.csv", header = T, dec = ".", sep = ";")
fisher.test(tab2, workspace = 200000, simulate.p.value=T)
Wenn ich diese Befehle benutze, bekomme ich egal mit welcher Datenkombination (ob Ausgangsgestein und Bodentyp oder Ausgangsgestein und Kationenaustauschkapazität) diesen exakt gleichen Output:
p-value = 0.0004998
alternative hypothesis: two.sided

Ich habe noch folgendes probiert, aber dann bekomme ich nur Fehlermeldungen....

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fisher.test(tab2)
Wäre toll, wenn jemand von euch eine Idee hat. Gerne auch einen Vorschlag für einen anderen Unabhängigkeitstest, falls ihr denkt, dass dieser keinen Sinn macht.

Vielen Dank :)

Re: Fisher's exact test

Verfasst: Mi Jul 04, 2018 11:29 pm
von EDi
Wieso nicht pixelweise Korrelation?

Re: Fisher's exact test

Verfasst: Do Jul 05, 2018 10:08 pm
von Julia_S
Wie genau würdest du das dann machen?