Re: Filtern mittels regex Syntax
Verfasst: Mi Apr 17, 2019 4:35 pm
Danke schön,
ich habe auch eine praktikable Lösung gefunden. Wie du bereits erwähnt hast kann man ja die Regexp Terme mit einem oder verknüpfen. Das funktioniert ganz gut für mich.
Gruß
Werner
ich habe auch eine praktikable Lösung gefunden. Wie du bereits erwähnt hast kann man ja die Regexp Terme mit einem oder verknüpfen. Das funktioniert ganz gut für mich.
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collagen <- c("\\bCOL1A1\\b|\\bCOL1A2\\b|\\bCOL2A1\\b|\\bCOL3A1\\b|\\bCOL4A1\\b|\\bCOL4A2\\b|\\bCOL4A3\\b|\\bCOL4A4\\b|\\bCOL4A5\\b|\\bCOL4A6\\b|\\bCOL5A1\\b|\\bCOL5A2\\b|\\bCOL5A3\\b|\\bCOL6A1\\b|\\bCOL6A2\\b|\\bCOL6A3\\b|\\bCOL6A4P1\\b|\\bCOL6A4P2\\b|\\bCOL6A5\\b|\\bCOL6A6\\b|\\bCOL7A1\\b|\\bCOL8A1\\b|\\bCOL8A2\\b|\\bCOL9A1\\b|\\bCOL9A2\\b|\\bCOL9A3\\b|\\bCOL10A1\\b|\\bCOL11A1\\b|\\bCOL11A2\\b|\\bCOL12A1\\b|\\bCOL13A1\\b|\\bCOL14A1\\b|\\bCOL15A1\\b|\\bCOL16A1\\b|\\bCOL17A1\\b|\\bCOL18A1\\b|\\bCOL19A1\\b|\\bCOL20A1\\b|\\bCOL21A1\\b|\\bCOL22A1\\b|\\bCOL23A1\\b|\\bCOL24A1\\b|\\bCOL25A1\\b|\\bCOL26A1\\b|\\bCOL27A1\\b|\\bCOL28A1|\\bOI4\\b|\\bOI4\\b|\\bSEDC\\b|\\b AOM\\b|\\b STL1\\b|\\bEDS4A\\b|\\bFLJ22259\\b|\\b DKFZp686I14213\\b|\\bCA44\\b|\\bASLN\\b|\\b ATS\\b|\\bDVWA\\b|\\b VWA6\\b|\\b DIVA\\b|\\b COL6A4\\b|\\b COL6A4P\\b|\\bCOL6A4\\b|\\bCOL29A1\\b|\\b FLJ35880\\b|\\b VWA4\\b|\\bEBDCT\\b|\\b EBD1\\b|\\b EBR1\\b|\\bC3orf7\\b|\\b MGC9568\\b|\\bFECD\\b|\\b PPCD\\b|\\b FECD1\\b|\\b PPCD2\\b|\\bEDM2\\b|\\b MED\\b|\\bIDD\\b|\\b MED\\b|\\b EDM3\\b|\\b FLJ90759\\b|\\b DJ885L7.4.1\\b|\\bCOLL6\\b|\\b STL2\\b|\\b CO11A1\\b|\\bDFNA13\\b|\\b DFNB53\\b|\\b HKE5\\b|\\bCOL12A1L\\b|\\bUND\\b|\\bBPAG2\\b|\\b BP180\\b|\\bKNO\\b|\\b KS\\b|\\b KNO1\\b|\\bKIAA1510\\b|\\bDKFZp434K0621\\b|\\bEMID2\\b|\\b Emu2\\b|\\b EMI6\\b|\\bKIAA1870\\b|\\b MGC11337\\b|\\b FLJ11895\\b") # Alle Collagene inklusive Aliase aus gennames.org
Barriere62 <- Daten[grepl(collagen, Daten$`Primary Sequence Name`),] # Genselection z.B.- Barriere etc
Werner