Error mit wilkox_test aus coin

[Kah]

Hat wer Erfahrung mit dem wilkox_test aus coin? (nicht wilcox.test)
Ich habe paired values, mit denen der wilcox.test wohl nicht klarkommt, daher coin.

wilcox_test(Messdaten$Abund~Messdaten$Type, distribution = "exact")
erzeugt die Fehlermeldung:
Error in xtrafo(object@x) : data class “character” is not supported

In allen Beispielen, die ich gefunden habe, lag die gruppierende Variable immer als character vor. Numerische Werte funktionieren aber auch nicht.

Meine Daten für Abund sind: [1] 14 15 69 14 30 40 30 17 24 56 27 20 32 26 14 13
Type: [1] "planted" "planted" "lawn" "lawn" "planted" "planted" "lawn" "lawn"
[9] "planted" "planted" "lawn" "lawn" "planted" "planted" "lawn" "lawn"

Freue mich über Ideen!

[student]

Ich habe zum Wilcox-Test mal etwas allgemeineres gemacht und hier speziell für Deine Fragestellung:

Code: Alles auswählen

> daten <- data.frame(a, b)
> daten
    a       b
1  14 planted
2  15 planted
3  69    lawn
4  14    lawn
5  30 planted
6  40 planted
7  30    lawn
8  17    lawn
9  24 planted
10 56 planted
11 27    lawn
12 20    lawn
13 32 planted
14 26 planted
15 14    lawn
16 13    lawn

> str(daten)
'data.frame':	16 obs. of  2 variables:
 $ a: num  14 15 69 14 30 40 30 17 24 56 ...
 $ b: Factor w/ 2 levels "lawn","planted": 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 ...
 
> wt <- coin::wilcox_test(a ~ b, data = daten)
> wt

	Asymptotic Wilcoxon-Mann-Whitney Test

data:  a by b (lawn, planted)
Z = -1.1068, p-value = 0.2684
alternative hypothesis: true mu is not equal to 0

Dir wird auffallen, dass "planted" und "lawn" als Faktoren vorliegen. Ich denke, dass ist das Problem in Deinem Datensatz. Die Fehlermeldung weißt darauf hin...

[Kah]

Danke für die schnelle Antwort!

Du meinst aber, DASS die gruppierende Vaiable als Faktor vorliegen muss, richtig?

Ich habe sie jetzt mit

Messdaten$Type <- factor(Messdaten$Type)

als Faktor neu gespeichert und jetzt funktionierts!

[Kah]

Noch eine Anschlussfrage:

wie lässt sich der Befehl

alternative="greater" oder alternative="less"

anwenden? Beide Varianten ergeben einen niedrigeren p-Wert, allerdings weiß ich nicht, auf welche Gruppe sich das greater oder lesser dann bezieht.

Die Schreibeweise mit Komma statt ~ wie im wilcox.test scheint mit coin nicht zu funktionieren. Sie produziert die Fehlermeldung:

no applicable method for 'wilcox_test' applied to an object of class "c('integer', 'numeric')"


Danke danke

[student]

Schau mal in die Hilfe zu coin::wilcox_test (Wegen des Zeichensatzes habe ich den Hilfeauszug als Bild eingefügt). Es spielt die "Art" der Hypothesenprüfung eine Rolle.

Das ...

Die Schreibeweise mit Komma statt ~ wie im wilcox.test scheint mit coin nicht zu funktionieren. Sie produziert die Fehlermeldung:

no applicable method for 'wilcox_test' applied to an object of class "c('integer', 'numeric')"

... verstehe ich nicht. Ich kann nicht erkennen, wie dieser Fehler produziert wird, außer dass numerische Werte oder Ganzzahlwerte erwartet werden (deswegen ja auch der Weg über "factor").

Die R-Hilfe-Funktion ist immer ein guter Weg um sich über Feinheiten im Funktonsaufruf zu informieren. Dort findest Du auch immer "Standardbeispiele" wie die Funktion genutzt wird.