Filtern mittels regex Syntax

Wie erweitere ich R um eigene Funktionen oder Pakete? Welches Paket ist passend für meine Fragestellung?

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wbart
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Re: Filtern mittels regex Syntax

Beitrag von wbart » Mi Apr 17, 2019 4:35 pm

Danke schön,

ich habe auch eine praktikable Lösung gefunden. Wie du bereits erwähnt hast kann man ja die Regexp Terme mit einem oder verknüpfen. Das funktioniert ganz gut für mich.

Code: Alles auswählen

collagen <- c("\\bCOL1A1\\b|\\bCOL1A2\\b|\\bCOL2A1\\b|\\bCOL3A1\\b|\\bCOL4A1\\b|\\bCOL4A2\\b|\\bCOL4A3\\b|\\bCOL4A4\\b|\\bCOL4A5\\b|\\bCOL4A6\\b|\\bCOL5A1\\b|\\bCOL5A2\\b|\\bCOL5A3\\b|\\bCOL6A1\\b|\\bCOL6A2\\b|\\bCOL6A3\\b|\\bCOL6A4P1\\b|\\bCOL6A4P2\\b|\\bCOL6A5\\b|\\bCOL6A6\\b|\\bCOL7A1\\b|\\bCOL8A1\\b|\\bCOL8A2\\b|\\bCOL9A1\\b|\\bCOL9A2\\b|\\bCOL9A3\\b|\\bCOL10A1\\b|\\bCOL11A1\\b|\\bCOL11A2\\b|\\bCOL12A1\\b|\\bCOL13A1\\b|\\bCOL14A1\\b|\\bCOL15A1\\b|\\bCOL16A1\\b|\\bCOL17A1\\b|\\bCOL18A1\\b|\\bCOL19A1\\b|\\bCOL20A1\\b|\\bCOL21A1\\b|\\bCOL22A1\\b|\\bCOL23A1\\b|\\bCOL24A1\\b|\\bCOL25A1\\b|\\bCOL26A1\\b|\\bCOL27A1\\b|\\bCOL28A1|\\bOI4\\b|\\bOI4\\b|\\bSEDC\\b|\\b AOM\\b|\\b STL1\\b|\\bEDS4A\\b|\\bFLJ22259\\b|\\b DKFZp686I14213\\b|\\bCA44\\b|\\bASLN\\b|\\b ATS\\b|\\bDVWA\\b|\\b VWA6\\b|\\b DIVA\\b|\\b COL6A4\\b|\\b COL6A4P\\b|\\bCOL6A4\\b|\\bCOL29A1\\b|\\b FLJ35880\\b|\\b VWA4\\b|\\bEBDCT\\b|\\b EBD1\\b|\\b EBR1\\b|\\bC3orf7\\b|\\b MGC9568\\b|\\bFECD\\b|\\b PPCD\\b|\\b FECD1\\b|\\b PPCD2\\b|\\bEDM2\\b|\\b MED\\b|\\bIDD\\b|\\b MED\\b|\\b EDM3\\b|\\b FLJ90759\\b|\\b DJ885L7.4.1\\b|\\bCOLL6\\b|\\b STL2\\b|\\b CO11A1\\b|\\bDFNA13\\b|\\b DFNB53\\b|\\b HKE5\\b|\\bCOL12A1L\\b|\\bUND\\b|\\bBPAG2\\b|\\b BP180\\b|\\bKNO\\b|\\b KS\\b|\\b KNO1\\b|\\bKIAA1510\\b|\\bDKFZp434K0621\\b|\\bEMID2\\b|\\b Emu2\\b|\\b EMI6\\b|\\bKIAA1870\\b|\\b MGC11337\\b|\\b FLJ11895\\b") # Alle Collagene inklusive Aliase aus gennames.org

Barriere62 <- Daten[grepl(collagen, Daten$`Primary Sequence Name`),]   # Genselection z.B.- Barriere etc
Gruß
Werner

jogo
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Re: Filtern mittels regex Syntax

Beitrag von jogo » Mi Apr 17, 2019 8:04 pm

auch schön.

Gruß, Jörg

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