Probleme mit image.plot
Verfasst: Do Jan 23, 2020 12:45 pm
Ich möchte gerne eine heatmap mittels der Funktion image.plot erstellen. Dazu habe ich eine große Tabelle eingelesen (damit hatte ich zuerst Probleme, siehe mein letzter Beitrag). Das hat gfunktioniert. Diese Tabelle teile ich dann nochmal in drei kleinere Dataframes, um diese dann einzeln zu plotten.
"Maecht" soll bei der Heatmap die Höhe der Zeilen bestimmen.
Das ist mein bisheriger code. Ganz unten seht ihr den ersten Versuch garins_T zu plotten.
ich bekomme dann aber folgende fehlermeldung:
Auch dazu finde ich keine passende Lösung im Internet. Ich verstehe nicht mal, was diese Fehlermeldung bedeutet.
Danke schonmal für eventuelle Rückmeldungen!
P.S.: ich habe meine Datensätze mal angehängt.
"Maecht" soll bei der Heatmap die Höhe der Zeilen bestimmen.
Das ist mein bisheriger code. Ganz unten seht ihr den ersten Versuch garins_T zu plotten.
Code: Alles auswählen
grains_txt <- read.table("F:/Kanarenprojekt/Korngrößenanalyse/Lanzarote/Lanz_I/Korngrößen_P1.txt", dec=",",stringsAsFactors = FALSE)
Maecht <- read.csv("F:/Kanarenprojekt/Korngrößenanalyse/Lanzarote/Lanz_I/Maecht_P1.csv",header=TRUE, row.names=1, sep=";", dec = ".",stringsAsFactors = FALSE)
str(grains_txt)
grains_trans<- t(grains_txt)
grains_trans_T<- grains_trans[1:27,]
grains_trans_U<- grains_trans[28:52,]
grains_trans_S<- grains_trans[53:80,]
win.metafile(filename = "P1_Heatmap")
par(mfrow=c(1,13),
mar=c(0.5, 0.5, 2, 0.5))
grains_T <-t(grains_trans_T)
grains_U <-t(grains_trans_U)
grains_S <-t(grains_trans_S)
image.plot(c(0:ncol(grains_T)),c(Maecht$Maecht3),log(t(grains_T)), zlim= c(log(0.1), log(5)), col=blue2green2red(50), horizontal = TRUE, legend.width = 0.5, xaxt = "n", yaxt = "n", xlab = "", ylab = "")Code: Alles auswählen
Error in plot.window(...) : endliche 'ylim' Werte nötig
In addition: Warning messages:
1: In min(x, na.rm = na.rm) :
no non-missing arguments to min; returning Inf
2: In max(x, na.rm = na.rm) :
no non-missing arguments to max; returning -Inf
3: In min(x, na.rm = na.rm) :
no non-missing arguments to min; returning Inf
4: In max(x, na.rm = na.rm) :
no non-missing arguments to max; returning -InfDanke schonmal für eventuelle Rückmeldungen!
P.S.: ich habe meine Datensätze mal angehängt.