Deutsches R-Forum

Verfasst: **Di Nov 22, 2022 10:26 am**

IBeim Versuch das Minimum in einer Spalte zu erhalten bekomme ich folgende Fehlermeldung:
Error in FUN(X[], ...) :
only defined on a data frame with all numeric-alike variables

Die Spalte mit den Werten ist aber numerisch.

leider kann ich die komplette Tabelle nicht teilen. Ich versuche die Infos trotzdem zu vermitteln

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# ich möchte den minimalen Wert erhalten
min(data$logFC)

die Spalte logFC ist numerisch vom Typ double

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> str(data)
'data.frame':	12 obs. of  14 variables:
 $ ensembleID       : chr  "ENSG00000182667" " ...
 $ geneSymbol       : chr  "NTM" ...
 $ geneName         : chr  "neurotrimin" " ...
 $ comparison       : chr  ...
 $ logFC            : num  ...
 $ ID               : chr  "1" "2" "3" "4" ...
 $ symbolType       : chr  " ...
 $ contributionTo   : chr  NA NA NA NA ...
 $ affilationGroup  : chr  NA NA NA NA ...
 $ resultsIn        : chr  " ...
 $ mechanismOfAction: chr  NA NA NA NA ...
 $ highlightedX     : chr  NA NA "xxx" NA ...
 $ source           : chr  " ...
 $ "comparison"     :  ...#


typeof(dGE_DNA_damage_response$logFC)
[1] "double"

Hat jemand eine Idee warum ich diese Meldung bekomme?

VG
wbart

Verfasst: **Di Nov 22, 2022 1:58 pm**

Hallo,

ich habe leider keine Idee. Wenn Du die Tabelle nicht teilen kannst oder willst, was völlig in Ordnung ist, vielleicht kannst Du einen Teil der Tabelle teilen. Schau doch mal ob der Fehler mit folgenden Daten auch auftritt.

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data[1:10, "logFC", drop = FALSE]

Wenn ja, kannst Du diese Daten vielleicht teilen (ohne Kontext sind die ja für jeden inhaltsleer)? Z. b. als

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dput(data[1:10, "logFC", drop = FALSE])

LG,
Bernhard

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Error: only defined on a data frame with all numeric-alike variables

Error: only defined on a data frame with all numeric-alike variables

Re: Error: only defined on a data frame with all numeric-alike variables