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Error mit wilkox_test aus coin
Verfasst: Mi Mai 24, 2023 4:57 pm
von Kah
Hat wer Erfahrung mit dem wilkox_test aus coin? (nicht wilcox.test)
Ich habe paired values, mit denen der wilcox.test wohl nicht klarkommt, daher coin.
wilcox_test(Messdaten$Abund~Messdaten$Type, distribution = "exact")
erzeugt die Fehlermeldung:
Error in xtrafo(object@x) : data class “character” is not supported
In allen Beispielen, die ich gefunden habe, lag die gruppierende Variable immer als character vor. Numerische Werte funktionieren aber auch nicht.
Meine Daten für Abund sind: [1] 14 15 69 14 30 40 30 17 24 56 27 20 32 26 14 13
Type: [1] "planted" "planted" "lawn" "lawn" "planted" "planted" "lawn" "lawn"
[9] "planted" "planted" "lawn" "lawn" "planted" "planted" "lawn" "lawn"
Freue mich über Ideen!
Re: Error mit wilkox_test aus coin
Verfasst: Mi Mai 24, 2023 6:20 pm
von student
Ich habe zum Wilcox-Test mal etwas
allgemeineres gemacht und hier speziell für Deine Fragestellung:
Code: Alles auswählen
> daten <- data.frame(a, b)
> daten
a b
1 14 planted
2 15 planted
3 69 lawn
4 14 lawn
5 30 planted
6 40 planted
7 30 lawn
8 17 lawn
9 24 planted
10 56 planted
11 27 lawn
12 20 lawn
13 32 planted
14 26 planted
15 14 lawn
16 13 lawn
> str(daten)
'data.frame': 16 obs. of 2 variables:
$ a: num 14 15 69 14 30 40 30 17 24 56 ...
$ b: Factor w/ 2 levels "lawn","planted": 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 ...
> wt <- coin::wilcox_test(a ~ b, data = daten)
> wt
Asymptotic Wilcoxon-Mann-Whitney Test
data: a by b (lawn, planted)
Z = -1.1068, p-value = 0.2684
alternative hypothesis: true mu is not equal to 0
Dir wird auffallen, dass "planted" und "lawn" als Faktoren vorliegen. Ich denke, dass ist das Problem in Deinem Datensatz. Die Fehlermeldung weißt darauf hin...
Re: Error mit wilkox_test aus coin
Verfasst: Mi Mai 24, 2023 8:16 pm
von Kah
Danke für die schnelle Antwort!
Du meinst aber, DASS die gruppierende Vaiable als Faktor vorliegen muss, richtig?
Ich habe sie jetzt mit
Messdaten$Type <- factor(Messdaten$Type)
als Faktor neu gespeichert und jetzt funktionierts!
Re: Error mit wilkox_test aus coin
Verfasst: Do Mai 25, 2023 11:50 am
von Kah
Noch eine Anschlussfrage:
wie lässt sich der Befehl
alternative="greater" oder alternative="less"
anwenden? Beide Varianten ergeben einen niedrigeren p-Wert, allerdings weiß ich nicht, auf welche Gruppe sich das greater oder lesser dann bezieht.
Die Schreibeweise mit Komma statt ~ wie im wilcox.test scheint mit coin nicht zu funktionieren. Sie produziert die Fehlermeldung:
no applicable method for 'wilcox_test' applied to an object of class "c('integer', 'numeric')"
Danke danke
Re: Error mit wilkox_test aus coin
Verfasst: Do Mai 25, 2023 3:23 pm
von student
Schau mal in die
Hilfe zu coin::wilcox_test (Wegen des Zeichensatzes habe ich den Hilfeauszug als
Bild eingefügt). Es spielt die "Art" der Hypothesenprüfung eine Rolle.
Das ...
Die Schreibeweise mit Komma statt ~ wie im wilcox.test scheint mit coin nicht zu funktionieren. Sie produziert die Fehlermeldung:
no applicable method for 'wilcox_test' applied to an object of class "c('integer', 'numeric')"
... verstehe ich nicht. Ich kann nicht erkennen, wie dieser Fehler produziert wird, außer dass
numerische Werte oder
Ganzzahlwerte erwartet werden (deswegen ja auch der Weg über "
factor").
Die R-Hilfe-Funktion ist immer ein guter Weg um sich über
Feinheiten im Funktonsaufruf zu informieren. Dort findest Du auch immer "Standardbeispiele" wie die Funktion genutzt wird.